Identifizierung von Leitmedikamenten durch molekulares Docking

Molekulares Docking ist eine rechnergestützte Methode zur Untersuchung der Bildung intermolekularer Komplexe eines niedermolekularen Liganden (Wirkstoff) mit einem Makromolekül, bei dem es sich in der Regel um ein Protein (Wirkstoffziel) mit bekannter dreidimensionaler Struktur handelt. Es können vier verschiedene Arten von Wechselwirkungen zwischen den Molekülen unterschieden werden: 1) Protein-Protein; 2) Protein-DNA; 3) DNA-Ligand und 4) Protein-Ligand. In den letzten Jahren haben die Verfügbarkeit von dreidimensionalen (3D) Strukturen für viele makromolekulare Zielmoleküle (Proteine) und die raschen Fortschritte in der computergestützten Chemie und Bioinformatik, sowohl in vitro als auch in silico, eine neue Plattform für die Entwicklung und Erforschung moderner computergestützter Methoden geschaffen. Wenn die 3-D-Struktur des makromolekularen Ziels bekannt ist, kann das Design der Berechnungsbibliothek an die Geometrie der Bindungsstelle angepasst werden. Darüber hinaus spart die Identifizierung von Bindungsstellen und Protein-Ligand-Wechselwirkungen mit Hilfe von Bioinformatik-Tools vor der Durchführung von Nasslaborstudien erheblich Energie, Zeit und Geld.